Falando com o FaBMak surgiu a dúvida de como definir prioridade entre repositórios para o apt sempre baixar o programa do repositório escolhido. A solução encontrada foi esta:
Primeiro crie o arquivo: /etc/apt/preferences
Agora adicione:
Package: NomeDoPacote
Pin: origin http://www.debian-multimedia.org
Pin-Priority: 600
Package: NomeDoPacote
Pin: origin http://www.ibiblio.org
Pin-Priority: 610
Package: NomeDoPacote
Pin: origin http://www.argon.org
[...]